Podría decirse que la más grande es Nature Vs Nurture. El debate sobre si una persona o alguien se convierte inevitablemente es más el resultado de su educación (Nutrición) o de quiénes son genéticamente (Naturaleza). ¿Te determinan más tus genes y tu herencia o las personas que te crían e influyen? Superman / Kal-El / Clark obviamente es kryptoniano genéticamente, pero fue criado como un ser humano en la Tierra por dos personas temerosas de Dios en la América media con valores pasados de moda. Superman en la película también fue un nacimiento natural, a diferencia de cómo el resto de los kryptonianos fueron diseñados genéticamente para cumplir un solo papel en su sociedad (soldado, científico, etc.). Así que el destino de Superman no estaba sellado por su genética, tenía que tomar sus propias decisiones.
Otros temas incluyen el miedo de la humanidad a lo que no comprenden y las áreas grises. La película trata sobre Superman que tiene que tomar decisiones que no son necesariamente en blanco y negro, y la película te recuerda constantemente el peligro que conlleva la idea de que la gente descubra que este ser masivamente poderoso camina entre ellos. La película dice más de lo que se muestra en ese sentido, pero el elemento Nature Vs Nurture se maneja muy bien.