Con suficiente tiempo y una separación completa, lo harían, pero probablemente no en la forma en que estás pensando.
Experimento de pensamiento: los extraterrestres se abalanzan, atrapan a 30 millones de humanos y transportan 10 millones de ellos a cada uno de los tres planetas que son duplicados exactos de la Tierra. Dispersan a estos colonos de manera uniforme en las áreas habitables, sin libros, herramientas u otra tecnología. Y no hay más contacto entre los planetas.
Supongamos además que ninguna de estas personas realiza ingeniería genética en seres humanos.
Si cada grupo de 10 millones de colonos hubiera sido seleccionado para representar aleatoriamente a todas las naciones, razas y culturas en la tierra, ¿cuánto tiempo pasaría antes de que los humanos en cualquier planeta ya no pudieran cruzarse con los habitantes de los otros dos planetas?
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Es imposible dar una respuesta definitiva, pero llevaría mucho tiempo, probablemente más de un millón de años. No puede ser más definitivo que eso, porque una mutación beneficiosa de forma improbable podría surgir en uno de esos mundos y barrer a la población en cualquier momento, comenzando una cascada de otros cambios selectivos.
¿Qué pasaría si cada colonia tuviera habitantes de un solo grupo “racial”, por ejemplo, europeos occidentales, centroafricanos y asiáticos orientales? ¿Haría alguna diferencia?
Y la respuesta, sorprendentemente, es que si bien podría, en teoría, cambiar las probabilidades de una separación temprana en una pequeña cantidad, la diferencia sería tan pequeña que no tendría sentido. La cantidad de diferenciación inicial en los genomas en cada mundo sería casi trivial, y nada de eso sería en áreas relacionadas con la reproducción.
Tl; dr: si aíslas las poblaciones reproductoras entre sí el tiempo suficiente, eventualmente obtendrás especies separadas, pero la diferenciación por “raza” o región no tendrá nada que ver con eso.