Primero, debe definir con precisión qué es un sistema operativo para usted. Podría significar solo el kernel, o podría significar todo. Y supongo que para usted el código abierto y el software libre son esencialmente los mismos (pero puede que le interesen las diferencias, es decir, la licencia).
La mayoría de las distribuciones de Linux son de código abierto. Y también lo son FreeBSD, OpenBSD, etc. Y muchos de los “sistemas operativos de juguete” (ver, por ejemplo, Proyectos – OSDev Wiki …) son de código abierto.
En los detalles, muchas distribuciones de Linux deben enviar (a veces opcionalmente) algunos fragmentos pequeños de software propietario (en particular, los controladores para algunas piezas de hardware, como las tarjetas gráficas Nvidia, que no tienen controladores de software gratuitos o algún tipo de firmware), así que son 99% de código abierto, no 100% de código abierto. Algunas distribuciones de Linux (aquí hay una lista) tienen mucho cuidado de evitar estas piezas propietarias (pero es posible que no puedan beneficiarse completamente de todo su software).
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